MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus brevis KB290 plasmid pKB290-8 DNA

Total Repeats: 196

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020828	CAA	2	6	37	42	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_020828	GCTAC	2	10	151	160	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
3	NC_020828	GAGT	2	8	164	171	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
4	NC_020828	TTCA	2	8	235	242	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5	NC_020828	GCT	2	6	318	323	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_020828	TTCC	2	8	353	360	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
7	NC_020828	AATT	2	8	435	442	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_020828	CAAG	2	8	577	584	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
9	NC_020828	TGT	2	6	635	640	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NC_020828	CTG	2	6	737	742	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_020828	T	7	7	875	881	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_020828	AAAG	2	8	1002	1009	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
13	NC_020828	TGA	2	6	1023	1028	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14	NC_020828	TGCT	2	8	1031	1038	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
15	NC_020828	A	6	6	1142	1147	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_020828	AAG	2	6	1151	1156	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17	NC_020828	ATT	2	6	1159	1164	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_020828	CTG	2	6	1201	1206	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_020828	AT	4	8	1234	1241	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_020828	AACT	2	8	1325	1332	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
21	NC_020828	T	6	6	1590	1595	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_020828	TGTTTT	2	12	1610	1621	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
23	NC_020828	GTG	2	6	1640	1645	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
24	NC_020828	TA	3	6	1867	1872	50 %	50 %	0 %	0 %	472279774
25	NC_020828	T	7	7	1974	1980	0 %	100 %	0 %	0 %	472279774
26	NC_020828	ATT	2	6	1983	1988	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472279774
27	NC_020828	AAC	2	6	2035	2040	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472279774
28	NC_020828	AAT	2	6	2073	2078	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472279774
29	NC_020828	GAT	2	6	2088	2093	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472279774
30	NC_020828	GTA	2	6	2140	2145	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472279774
31	NC_020828	TGTT	2	8	2167	2174	0 %	75 %	25 %	0 %	472279774
32	NC_020828	TTG	2	6	2194	2199	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472279774
33	NC_020828	TA	3	6	2217	2222	50 %	50 %	0 %	0 %	472279774
34	NC_020828	TA	3	6	2233	2238	50 %	50 %	0 %	0 %	472279774
35	NC_020828	CTT	2	6	2253	2258	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472279774
36	NC_020828	AAT	2	6	2259	2264	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472279774
37	NC_020828	AAC	2	6	2357	2362	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472279774
38	NC_020828	T	6	6	2372	2377	0 %	100 %	0 %	0 %	472279774
39	NC_020828	AGA	2	6	2384	2389	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472279774
40	NC_020828	T	7	7	2390	2396	0 %	100 %	0 %	0 %	472279774
41	NC_020828	A	6	6	2427	2432	100 %	0 %	0 %	0 %	472279774
42	NC_020828	GATA	2	8	2445	2452	50 %	25 %	25 %	0 %	472279774
43	NC_020828	AGA	2	6	2471	2476	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472279774
44	NC_020828	A	7	7	2510	2516	100 %	0 %	0 %	0 %	472279774
45	NC_020828	AAAG	2	8	2573	2580	75 %	0 %	25 %	0 %	472279774
46	NC_020828	AACAG	2	10	2657	2666	60 %	0 %	20 %	20 %	472279774
47	NC_020828	GC	3	6	2675	2680	0 %	0 %	50 %	50 %	472279774
48	NC_020828	A	7	7	2757	2763	100 %	0 %	0 %	0 %	472279774
49	NC_020828	AAG	2	6	2782	2787	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472279774
50	NC_020828	TGA	2	6	2847	2852	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472279775
51	NC_020828	AAAC	2	8	2866	2873	75 %	0 %	0 %	25 %	472279775
52	NC_020828	CAA	2	6	3004	3009	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472279775
53	NC_020828	A	6	6	3019	3024	100 %	0 %	0 %	0 %	472279775
54	NC_020828	CAA	2	6	3036	3041	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472279775
55	NC_020828	AAT	2	6	3046	3051	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472279775
56	NC_020828	AAG	2	6	3069	3074	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472279775
57	NC_020828	ACAA	2	8	3104	3111	75 %	0 %	0 %	25 %	472279775
58	NC_020828	TAC	2	6	3114	3119	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472279775
59	NC_020828	CAA	2	6	3127	3132	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472279775
60	NC_020828	CAA	3	9	3163	3171	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472279775
61	NC_020828	AAC	2	6	3180	3185	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472279775
62	NC_020828	AGA	2	6	3189	3194	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472279775
63	NC_020828	AG	3	6	3199	3204	50 %	0 %	50 %	0 %	472279775
64	NC_020828	A	6	6	3221	3226	100 %	0 %	0 %	0 %	472279775
65	NC_020828	AGA	2	6	3282	3287	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472279775
66	NC_020828	ATAAAA	2	12	3296	3307	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	472279775
67	NC_020828	TGG	2	6	3319	3324	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472279775
68	NC_020828	TTA	2	6	3401	3406	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_020828	GAA	2	6	3418	3423	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
70	NC_020828	AAT	2	6	3494	3499	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_020828	AGCT	2	8	3520	3527	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
72	NC_020828	TATT	2	8	3574	3581	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_020828	GAT	2	6	3685	3690	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472279776
74	NC_020828	A	6	6	3698	3703	100 %	0 %	0 %	0 %	472279776
75	NC_020828	TGA	2	6	3709	3714	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472279776
76	NC_020828	TAATTG	2	12	3777	3788	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	472279776
77	NC_020828	T	6	6	3854	3859	0 %	100 %	0 %	0 %	472279776
78	NC_020828	TAT	2	6	3943	3948	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472279776
79	NC_020828	ATT	3	9	4021	4029	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472279776
80	NC_020828	CATT	2	8	4047	4054	25 %	50 %	0 %	25 %	472279776
81	NC_020828	GAC	2	6	4172	4177	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_020828	AGC	2	6	4275	4280	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_020828	AGT	2	6	4330	4335	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
84	NC_020828	ATG	2	6	4355	4360	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
85	NC_020828	GTCTT	2	10	4417	4426	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
86	NC_020828	ATT	2	6	4477	4482	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_020828	TTGT	2	8	4493	4500	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
88	NC_020828	AATC	2	8	4513	4520	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
89	NC_020828	TTCTAT	2	12	4576	4587	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
90	NC_020828	A	6	6	4623	4628	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_020828	AAT	2	6	4748	4753	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_020828	ATG	2	6	4774	4779	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
93	NC_020828	ACTATA	2	12	4824	4835	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
94	NC_020828	TGC	2	6	4944	4949	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_020828	TAC	2	6	4967	4972	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472279777
96	NC_020828	GA	3	6	4982	4987	50 %	0 %	50 %	0 %	472279777
97	NC_020828	T	7	7	5062	5068	0 %	100 %	0 %	0 %	472279777
98	NC_020828	GTG	2	6	5076	5081	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472279777
99	NC_020828	T	6	6	5086	5091	0 %	100 %	0 %	0 %	472279777
100	NC_020828	T	6	6	5104	5109	0 %	100 %	0 %	0 %	472279777
101	NC_020828	CAA	2	6	5232	5237	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472279777
102	NC_020828	A	6	6	5239	5244	100 %	0 %	0 %	0 %	472279777
103	NC_020828	AT	3	6	5259	5264	50 %	50 %	0 %	0 %	472279777
104	NC_020828	T	6	6	5272	5277	0 %	100 %	0 %	0 %	472279777
105	NC_020828	TAG	2	6	5280	5285	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472279777
106	NC_020828	T	7	7	5323	5329	0 %	100 %	0 %	0 %	472279777
107	NC_020828	T	6	6	5334	5339	0 %	100 %	0 %	0 %	472279777
108	NC_020828	T	8	8	5341	5348	0 %	100 %	0 %	0 %	472279777
109	NC_020828	AGTAAA	3	18	5381	5398	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	472279777
110	NC_020828	AG	3	6	5422	5427	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
111	NC_020828	TAAA	3	12	5444	5455	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_020828	CAAAC	2	10	5499	5508	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
113	NC_020828	TAT	2	6	5562	5567	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_020828	CAA	2	6	5597	5602	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_020828	A	9	9	5681	5689	100 %	0 %	0 %	0 %	472279778
116	NC_020828	TGC	2	6	5734	5739	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472279778
117	NC_020828	TCA	2	6	5767	5772	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472279778
118	NC_020828	AGC	2	6	5789	5794	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472279778
119	NC_020828	AACA	2	8	5808	5815	75 %	0 %	0 %	25 %	472279778
120	NC_020828	AGT	2	6	5816	5821	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472279778
121	NC_020828	A	8	8	5822	5829	100 %	0 %	0 %	0 %	472279778
122	NC_020828	CTT	2	6	5847	5852	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472279778
123	NC_020828	AGT	2	6	5861	5866	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472279778
124	NC_020828	CTA	2	6	5886	5891	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472279778
125	NC_020828	CTA	2	6	5895	5900	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472279778
126	NC_020828	CAA	2	6	5903	5908	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472279778
127	NC_020828	TTC	2	6	5914	5919	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472279778
128	NC_020828	AGT	2	6	5930	5935	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472279778
129	NC_020828	CAG	2	6	5946	5951	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472279778
130	NC_020828	TAC	2	6	5962	5967	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472279778
131	NC_020828	TCAA	2	8	6117	6124	50 %	25 %	0 %	25 %	472279778
132	NC_020828	TAAAA	2	10	6146	6155	80 %	20 %	0 %	0 %	472279778
133	NC_020828	T	6	6	6195	6200	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_020828	ACCT	2	8	6224	6231	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
135	NC_020828	AAC	2	6	6242	6247	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_020828	CGC	2	6	6297	6302	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
137	NC_020828	T	6	6	6333	6338	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_020828	T	6	6	6366	6371	0 %	100 %	0 %	0 %	472279779
139	NC_020828	TCT	2	6	6376	6381	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472279779
140	NC_020828	ATTCTA	2	12	6449	6460	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	472279779
141	NC_020828	T	6	6	6636	6641	0 %	100 %	0 %	0 %	472279779
142	NC_020828	ATC	2	6	6657	6662	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472279779
143	NC_020828	ATA	2	6	6663	6668	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472279779
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183	NC_020828	TCA	2	6	7988	7993	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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195	NC_020828	ATT	3	9	8520	8528	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
196	NC_020828	CAAGT	2	10	8530	8539	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.